Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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