Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP1Q00587 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms