Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms