Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP3P57721 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms