Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms