Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms