Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms