Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPD2P43304 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPD2P43304 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPD2P43304 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPD2P43304 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPD2P43304 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GPD2P43304 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPD2P43304 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPD2P43304 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPD2P43304 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPD2P43304 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPD2P43304 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GPD2P43304 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPD2P43304 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPD2P43304 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPD2P43304 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms