Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKARP32238 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKARP32238 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms