Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFNP31947 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFNP31947 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFNP31947 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms