Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5AP29375 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms