Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
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