Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms