Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms