Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms