Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSLP07711 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSLP07711 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSLP07711 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms