Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms