Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR11A4FU01 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms