Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms