Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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