Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms