Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms