Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms