Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms