Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms