Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms