Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms