Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms