Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms