Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms