Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms