Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms