Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms