Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms