Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LNX2Q8N448 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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