Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS1Q86UR5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS1Q86UR5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms