Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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