Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms