Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms