Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms