Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SAMD13Q5VXD3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SAMD13Q5VXD3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SAMD13Q5VXD3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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