Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms