Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCAQ16586 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCAQ16586 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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