Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF13Q15543 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms