Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CYTH1Q15438 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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