Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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