Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PCM1Q15154 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PCM1Q15154 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PCM1Q15154 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PCM1Q15154 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PCM1Q15154 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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