Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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