Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms