Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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